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全基因組甲基因測序

來源:萬物生物   發布時間:2021-11-02

全基因組DNA甲基化測序

全基因組DNA甲基化測序(Whole Genome Bisulfite SequencingWGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina高通量測序平臺相結合,對有參考基因組的物種在全基因組水平進行高精準甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態,從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。

基于全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法,實現單堿基分辨率的甲基化位點精準、高效定位。精準獲得全基因組甲基化的C位點,是甲基化測序的金標準;全面分析不同處理對全基因組甲基化水平的影響,快速準確地找到差異甲基化區域。具有高效、精準、超值的優勢,已廣泛應用于人和動植物研究。

 

WGBS

分析內容

解決問題

標準分析

測序數據質量評估

過濾掉低質量數據,保證數據質量

與參考基因組比對

比對率和覆蓋度分析

甲基化位點calling

分析甲基化位點

甲基化分布

甲基化在基因組,染色體,功能元件上的分布

差異甲基化分析

尋找DMR

相關基因分析

相關基因GOKEGG富集分析

多樣本分析

PCA分析多樣本甲基化變化規律

 


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